Столицей Ленкоранского ханства была вначале Астара.

Однако впоследствии столица была перенесена в город Ленкаран. В период правления Сеид Аббаса, который происходил из рода Сефеви (Сефевиды), ханство признало власть Надир шаха Афшара. В 1747 году к власти в ханстве приходит Джамал ад-Дин Мирза бек (Гара-хан). Гара-хан больше всего склонялся к союзу с Россией.

Желание Гара-хана сблизиться с Россией вызвало недовольство гилянского правителя Гидаят хана. В 1768 году он напал на Талышское ханство. Гара-хан попал в плен и, лишь заплатив огромный выкуп, был освобожден.

В 1785 году ханство попадает в зависимость от Губинского ханства. А в 1795 году на ханство напал Ага Мухаммад хан Гаджар. Правитель ханства – Мир Мустафа хан занял оборону на одном из островов в Каспийском море и послал делегацию в Петербург и на Северный Кавказ, чтобы сблизиться с русскими. К сожалению, хан не понимал, что самым опасным для ханства, да и для всего Азербайджана было сближение с Россией.