В марте 2000 года внутри сепаратистского режима в Нагорном Карабахе резко обострилось противоречие между ее руководителями. Давно тлевшая неприязнь между командиром вооруженных формирований сепаратистов Самвелом Бабаяном и «президентом» так называемой «НКР» Аркадием Гукасяном, после отставки С.Бабаяна в декабре 1999 года, перешла в открытую стычку. С.Бабаян был обвинен в организации покушения на А.Гукасяна и арестован.

Тем временем, в мирном диалоге между Азербайджаном и Арменией, вновь наступила пауза. Это было вызвано резким обострением внутриполитической ситуации в Армении и в стане карабахских сепаратистов. В то же время в Азербайджане и Армении шли общественные дебаты по обязательствам двух  стран в связи предстоящим членством в Совете Европы. Среди обязательств были и пункты, связанные с карабахским вопросом.

25 марта 2000 г. – В Милли Меджлисе был обсужден и принят документ об обязательствах страны после вступления Азербайджана в Совет Европы. Документ, подготовленный Политическим комитетом Парламентской ассамблеи Совета Европы, была подписана руководителями политических партий, представленных в Милли Меджлисе. Среди обязательств был и пункт об исключительно мирном решении карабахской проблемы.

19 августа 2000 г. – На неформальном саммите глав государств СНГ, проходящем в Ялте (Украина), состоялась еще одна встреча между президентом Азербайджана Гейдаром Алиевым и президентом Армении Робертом Кочаряном.

7 сентября 2000 г. – Президент Азербайджана Гейдар Алиев, участвующий на проходящем в Нью-Йорке «Саммите тысячелетия» ООН, выступил на торжественном заседании Генеральной Ассамблеи. Президент Азербайджана заявил, что оставаясь безучастным наблюдателем действиям агрессора, мировое сообщество тем самым пропагандирует агрессию.